Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOEP02649 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOEP02649 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOEP02649 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOEP02649 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOEP02649 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOEP02649 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOEP02649 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOEP02649 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOEP02649 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOEP02649 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOEP02649 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOEP02649 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOEP02649 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOEP02649 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOEP02649 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOEP02649 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOEP02649 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOEP02649 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOEP02649 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOEP02649 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOEP02649 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOEP02649 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOEP02649 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOEP02649 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOEP02649 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOEP02649 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOEP02649 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APOEP02649 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOEP02649 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms