Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COBLO75128 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COBLO75128 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLO75128 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLO75128 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLO75128 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLO75128 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLO75128 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COBLO75128 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COBLO75128 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COBLO75128 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COBLO75128 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLO75128 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COBLO75128 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLO75128 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLO75128 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLO75128 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLO75128 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLO75128 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLO75128 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COBLO75128 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COBLO75128 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COBLO75128 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLO75128 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLO75128 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLO75128 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLO75128 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLO75128 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLO75128 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLO75128 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COBLO75128 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COBLO75128 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COBLO75128 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COBLO75128 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COBLO75128 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COBLO75128 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLO75128 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLO75128 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLO75128 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLO75128 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLO75128 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COBLO75128 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COBLO75128 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLO75128 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COBLO75128 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COBLO75128 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COBLO75128 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COBLO75128 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COBLO75128 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COBLO75128 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLO75128 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLO75128 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLO75128 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLO75128 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLO75128 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLO75128 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLO75128 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLO75128 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLO75128 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLO75128 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLO75128 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COBLO75128 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms