Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD5O60279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD5O60279 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms