Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKNO60260 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKNO60260 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKNO60260 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKNO60260 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKNO60260 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKNO60260 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKNO60260 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKNO60260 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKNO60260 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKNO60260 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKNO60260 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKNO60260 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKNO60260 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKNO60260 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKNO60260 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKNO60260 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKNO60260 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKNO60260 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKNO60260 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKNO60260 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKNO60260 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKNO60260 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKNO60260 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKNO60260 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKNO60260 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKNO60260 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKNO60260 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKNO60260 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKNO60260 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKNO60260 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKNO60260 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms