Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL13O43927 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL13O43927 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL13O43927 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL13O43927 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms