Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BMQ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BMQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BMQ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BMQ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BMQ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BMQ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BMQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BMQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BMQ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BMQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BMQ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BMQ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BMQ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BMQ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BMQ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BMQ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BMQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BMQ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BMQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BMQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BMQ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BMQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BMQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BMQ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BMQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BMQ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BMQ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms