Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8VRH5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8VRH5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8VRH5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8VRH5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
F8VRH5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
F8VRH5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8VRH5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8VRH5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8VRH5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8VRH5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8VRH5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8VRH5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8VRH5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8VRH5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8VRH5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8VRH5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms