Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF233A6NK53 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms