Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRGMA1A4Y4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms