Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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