Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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