Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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