Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX5Q9Y5X3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms