Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAN1Q9Y2M0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAN1Q9Y2M0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms