Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP20Q9Y2K6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP20Q9Y2K6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP20Q9Y2K6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms