Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB2Q9UPW6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms