Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C4Q9UKN8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms