Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXW11Q9UKB1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXW11Q9UKB1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXW11Q9UKB1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXW11Q9UKB1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXW11Q9UKB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms