Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NPC1L1Q9UHC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NPC1L1Q9UHC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms