Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DKK2Q9UBU2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms