Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC6Q9UBN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC6Q9UBN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms