Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms