Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms