Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCMF1Q9P0J7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCMF1Q9P0J7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms