Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX1Q9NSU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX1Q9NSU2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX1Q9NSU2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX1Q9NSU2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX1Q9NSU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX1Q9NSU2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX1Q9NSU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TREX1Q9NSU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREX1Q9NSU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms