Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3AQ9NNX9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3AQ9NNX9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms