Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1EQ9GZS1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1EQ9GZS1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1EQ9GZS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 918.6 ms