Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR12Q9GZL7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR12Q9GZL7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR12Q9GZL7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms