Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNHG12Q9BXW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNHG12Q9BXW3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms