Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC106Q9BWC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC106Q9BWC9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC106Q9BWC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC106Q9BWC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms