Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD5Q99717 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms