Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAP1Q96NZ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAP1Q96NZ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAP1Q96NZ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAP1Q96NZ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.4 ms