Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM47Q96LD4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM47Q96LD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms