Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PRAC1Q96KF2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms