Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS50Q96JG6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS50Q96JG6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms