Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms