Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM10Q96HG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM10Q96HG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms