Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGAP3Q96FM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGAP3Q96FM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGAP3Q96FM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGAP3Q96FM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms