Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB1CQ92928 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB1CQ92928 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1CQ92928 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms