Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKA2Q8WVK7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKA2Q8WVK7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms