Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WHAMMQ8TF30 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WHAMMQ8TF30 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms