Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC1AQ8NC01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC1AQ8NC01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC1AQ8NC01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC1AQ8NC01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms