Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTL3Q8N8U3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL3Q8N8U3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL3Q8N8U3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms