Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M1

ATPAF2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF2Q8N5M1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATPAF2Q8N5M1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATPAF2Q8N5M1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATPAF2Q8N5M1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATPAF2Q8N5M1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATPAF2Q8N5M1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATPAF2Q8N5M1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATPAF2Q8N5M1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF2Q8N5M1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATPAF2Q8N5M1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms