Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC2Q8N394 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC2Q8N394 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMTC2Q8N394 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMTC2Q8N394 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms