Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVBPQ8N300 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms