Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBBP6Q7Z6E9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBBP6Q7Z6E9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms