Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR53Q7Z5U6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms