Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT2Q7L5N7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms