Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD1Q6SPF0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD1Q6SPF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms